Историята на манастира „Св. Йоан Рилски” е обвита в легенди и предания. И до днес се разказва, че негов основател през Х в. бил цар Петър I и вероятно той му дал името на светеца от Рила, с когото някога много искал да се срещне.
Местните жители разказват, че тук светецът имал колиба, в която се подвизавал, преди да се отправи за Рилската пустиня.
Според преданията, това място било второто отшелничество на свети Йоан Рилски. Когато светецът разбрал, че царски пратеници идват да го отведат при царя, той се отправил нагоре по течението на рекичката, опитвайки се да се скрие. По пътя обаче ожаднял и се помолил на Бога за вода. На мястото, където се молил, веднага бликнал свещен извор, наречен аязмо. По-късно, през XV век, на същото място пренощували светите мощи на св. Йоан Рилски, докато ги връщали в Рилската света обител. За тези събития подробно разказва Владислав Граматик, който бил участник в процесията.
Владислав Граматик описва, че шествието, придружаващо мощите на светеца, спряло за почивка до река, наричана Герман, за „един ден и една нощ”. По време на престоя си там, те запалили „свещи и кандила” и извършили „молебствия”. Новината за пристигането на светите мощи бързо се разнесла и хората от околните села започнали да се събират при реката.
Владислав Граматик предава случилото се по следния начин: „Като се научиха за пристигането на светеца, жителите на околните села се събраха при реката, наричана Герман, в едно село, далеч от манастира на ден и половина път, и там го очакваха. Заедно с братята, като узна и игуменът, че светецът се приближава, дигна се с подвластните нему свещеници и дякони в манастира, взе свещи и кадила и тържествено го посрещна в гореказаното село при реката.”
Това описание свидетелства, че през 1469 година Германският манастир бил активен и действащ мъжки манастир, в който имало игумен и монаси. Манастирът вече бил известен и утвърден като важно духовно средище в района.